После создания препарата от вируса, человечество было спасено. Аракава построила новую лабораторию по изучению диклониусов. Почти все сельплиты были убиты, а тех, кого оставили были заточены в лаборатории. Но была ещё одна митохондральная Ева - диклониус Арису. получившаяся в результате передозировки родителей вирусом, Ари была способна к деторождению. Два года назад Аракава поймала ее, но она снова сбежала и теперь все силы брошены на ее поимку. Параллельно Аракава разрабатывает методику, которая уничтожит в диклониусах зов ДНК и они не будут убивать людей.
Арису ищет старого друга Алекса, которому она сильно насолила. Она хочет попросить прощения, но что-то идет не так и сущности диклониуса разделяется на две части. Вторая, Су, не использует векторы против людей и остается фактически беспомощна.